ساماندهي و بهينه‌سازي شرايط نگهداري مجموعه آثار در موزه ها و مخازن كشور (تهيه بانك اطلاعاتي حفاظتي اموال فرهنگي): در اين طرح پژوهشكده حفاظت و مرمت سعي بر آن دارد تا با برنامه ريزي منظم شرايط نگهداري و نمايش آثار در موزه ها ومخازن را پايش كرده و بهينه سازي نمايد. از اهداف اين طرح مي توان از: شرايط مناسب انبار آثار، بهينه‌سازي شرايط انبار، بسته‌بندي مناسب براي انبارداري، شيوه‌هاي مناسب نگهداري براي انواع مختلف آثار، نحوه تجهيز کارگاه‌هاي کوچک و پايه و روش‌هاي مختلف مورد نياز براي انجام اقدامات حفاظتي اضطراري نام برد.
 

مطالعه حفاظتي، مستندنگاري و تهيه همانند (مولاژ) از سنگ نبشته‌ها و نگاركندهاي صخره‌اي ايران : با توجه به سرعت فرسايشي نگاركندها و به ويژه سنگ نبشته‌ها، مستندنگاري‌هاي حاصله از طرح به عنوان اسناد دقيق تاريخي در پژوهش‌هاي آينده و به ويژه در حوزه‌هاي تاريخ و زبان‌شناسي ارزش قابل توجهي دارند. هدف از اجراي اين طرح: مطالعات فني و بررسي فرآيندهاي فرسايشي آثار ، مستندنگاري دقيق كتيبه‌ها و تهيه همانند (مولاژ) از نقش برجسته‌هاي محوطه‌هاي پاسارگاد و بيستون و بررسي وضعيت موجود كتيبه‌ها و نگاركندهاي صخره‌اي ايران و تعيين اولويت‌هاي حفاظتي مي باشد. با شناخت وضعيت موجود سنگ نوشته‌ها مي‌توان به برنامه‌ريزي مديريتي حفاظت از آنها سرعت بيشتري داد.
 

 تهيه اطلس معدن‌كاري و فلزكاري باستاني ايران : پيش نياز اجراي پروژه‌ مطالعات معدن‌كاري و فلزكاري كهن در ايران  شناسايي، جمع‌آوري و معرفي اطلاعات موجود و يا اطلاعات تازه درباره محل‌هاي معدن‌كاري و ذوب فلز و استحصال باستاني ايران به صورت يك اطلس است. بديهي است چنين اطلسي يك سند و منبع پايه‌اي و قابل اعتماد براي مطالعات بيشتر دربارة معدن كاري و ذوب فلز كهن ايران مي باشد. با عنايت به ميزان اهميت تهيه اطلس معدن‌كاري و فلزكاري ايران به عنوان اولين گام در بررسي سير تحول فن‌آوري آثار فلزي ، پژوهشکده حفاظت و مرمت آثار تاريخي-فرهنگي در نظر دارد با بكارگيري نيروهاي دانشجويي و با همكاري ساير مراكز تحقيقاتي مرتبط به اين امر مهم بپردازد.

 راه اندازي و تجهيز شبكه هاي ازمايشگاهي و كارگاهي حفاظت و مرمت در كشور (مرحله اول: استان هاي گيلان، خراسان شمالي، خوزستان، هرمزگان و سيستان وبلوچستان): تعدد اثار و اشياي موجود در كشور و همچنين موزه هايي كه در دست بهره برداري است، ضرورت راه اندازي و تجهيز يك شبكه ازمايشگاهي و كارگاهي را در جهت پاسخگويي به نيازهاي حفاظت ومرمت اشيا و تزيينات معماري  نشان مي دهد. از سويي كثرت محوطه هاي تاريخي و توسعه كاوش هاي باستان شناسي در كشور باعث شده استان هاي مختلف با حجم زياد ي از اثار مواجه شوند كه از شرايط نامناسب حفاظتي برخوردار بوده و نيازمند عمليات اضطراري حفاظت ومرمت هستند كه خود توسعه ازمايشگاه ها و كارگاه هاي حفاظت ومرمت را ضروري نشان مي دهد. لذا با توجه به مشكلات حفاظتي موجود و جوابگو نبودن كارگاه هاي موجود، اين طرح به موضوع راه اندازي و تجهيز مراكز ازمايشگاهي و كارگاهي در كشور مي پردازد و در نخستين مرحله پنج استان نيازمند كشور را كه تاكنون كمتر مورد توجه بوده است، پوشش خواهد داد. لازم به ذكر است مراكز تجهيز شده توانايي ان را خواهند داشت كه در كوتاه و ميان مدت به مناطق و استان هاي همجوار نيز ارايه خدمات ازمايشگاهي و كارگاهي نمايند.