ساماندهي و بهينه‌سازي شرايط نگهداري مجموعه آثار در موزه ها و مخازن كشور (تهيه بانك اطلاعاتي حفاظتي اموال فرهنگي): در اين طرح پژوهشكده حفاظت و مرمت سعي بر آن دارد تا با برنامه ريزي منظم شرايط نگهداري و نمايش آثار در موزه ها ومخازن را پايش كرده و بهينه سازي نمايد. از اهداف اين طرح مي توان از: شرايط مناسب انبار آثار، بهينه‌سازي شرايط انبار، بسته‌بندي مناسب براي انبارداري، شيوه‌هاي مناسب نگهداري براي انواع مختلف آثار، نحوه تجهيز کارگاه‌هاي کوچک و پايه و روش‌هاي مختلف مورد نياز براي انجام اقدامات حفاظتي اضطراري نام برد.
 

مطالعه حفاظتي، مستندنگاري و تهيه همانند (مولاژ) از سنگ نبشته‌ها و نگاركندهاي صخره‌اي ايران : با توجه به سرعت فرسايشي نگاركندها و به ويژه سنگ نبشته‌ها، مستندنگاري‌هاي حاصله از طرح به عنوان اسناد دقيق تاريخي در پژوهش‌هاي آينده و به ويژه در حوزه‌هاي تاريخ و زبان‌شناسي ارزش قابل توجهي دارند. هدف از اجراي اين طرح: مطالعات فني و بررسي فرآيندهاي فرسايشي آثار، مستندنگاري دقيق كتيبه‌ها و تهيه همانند (مولاژ) از نقش برجسته‌هاي محوطه‌هاي پاسارگاد و بيستون و بررسي وضعيت موجود كتيبه‌ها و نگاركندهاي صخره‌اي ايران و تعيين اولويت‌هاي حفاظتي مي باشد. با شناخت وضعيت موجود سنگ نوشته‌ها مي‌توان به برنامه‌ريزي مديريتي حفاظت از آنها سرعت بيشتري داد.
 

 ارزيابي روند تخريب ناشي از تغيير شرايط محيطي در محوطه‌هاي تاريخي پاسارگاد و تخت جمشيد (آبگيري سد سيوند): ساخت سد سيوند و آبگيري آن در آينده‌اي نزديك، سبب بروز پاره‌اي از نگراني‌ها نسبت به نحوه نگهداري و حفاظت آثار تاريخي ارزشمند پاسارگاد گرديده است. به نحوي که احتمال ايجاد عوارض محيطي ناشي از آبگيري سد بر شرايطي اقليمي منطقه و در نهايت تشديد فرسايش طبيعي مصالح سنگي ـ به ويژه در محوطه تاريخي پاسارگادـ به شدت احساس مي‌شود. بر اين اساس در طرح حاضر ضمن پيشنهاد راه‌اندازي و تجهيز مركزي جهت پايش مداوم شرايط اقليمي منطقه و مقايسه اطلاعات با داده‌هاي هواشناسي و اقليمي مربوط به زمان پيش از آغاز به کار سد، ارزيابي وضعيت منطقه در درازمدت و همچنين تغييرات احتمالي در روند فرسايش محوطه مورد نظر مي‌باشد. بديهي است ارزيابي‌ها مستلزم امکان انجام مطالعات پايه در زمينه‌هاي خاک شناسي، آب شناسي و هواشناسي در ايستگاه مي‌باشد. در نهايت امکان پردازش مجموعه اطلاعات پايه گردآوري شده در مراکز مطالعاتي بزرگتر استاني يا کشوري با همکاري ساير نهادهاي مسئول در اين زمينه وجود خواهد داشت .

تدوين معيارهاي مرمت اشياء و تزيينات وابسته به معماري (منشور مرمت) : با توجه به اينكه در كشور ما هنوز ضوابط مشخص و محكمي براي حفاظت و مرمت اشياء تاريخي – فرهنگي و تزيينات وابسته به معماري وجود ندارد. براي جلوگيري از چندگانگي برخورد‌هاي حفاظتي و مرمتي با اشياء تاريخي – فرهنگي و تزيينات وابسته به معماري، پژوهشكده طرح «تدوين معيارهاي مرمت اشياء و تزيينات وابسته به معماري ( منشور مرمت)» را براي اجرا در سال 1387 پيشنهاد مي‌كند. نتيجه انجام اين طرح ساماندهي موضوع حفاظت و مرمت در كشور مي باشد.

دومين نشست حفاظت و مرمت آثار تاريخي – فرهنگي كشور هاي آسياي مركزي و خاورميانه :  با توجه به تاسيس صندوق اعتباري ايران در يونسكو جهت حفظ و نگهداري ميراث فرهنگي ايران اسلامي در منطقه آسياي مركزي و خاور ميانه فرصتي پيش آمده كه مسئولين كشور هاي منطقه بار ديگر در ايران گرد هم آيند و دومين نشست منطقه اي برگزار گرددو همچنين كميته هاي كاري با همكاري پژوهشكده و موسسات فرهنگي همچون يونسكو، ايكروم و ايكوموس تشكيل گردد .